| «Актобе» Актобе Казахстан | 2 | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 | 1 | 4 | 66.7 |
| «Аякс Ласнамяэ» Таллин Эстония | 4 | 4 | 0 | 0 | 17 | 0 | 17 | 12 | 100.0 |
| «Б36» Торсхавн Фарерские о-ва | 2 | 2 | 0 | 0 | 4 | 2 | 2 | 6 | 100.0 |
| «Вадуц» Вадуц Лихтенштейн | 2 | 0 | 0 | 2 | 1 | 5 | -4 | 0 | 0.0 |
| «Валмиера» Валмиера Латвия | 1 | 1 | 0 | 0 | 2 | 1 | 1 | 3 | 100.0 |
| «Вапрус» Пярну Эстония | 28 | 22 | 4 | 2 | 90 | 18 | 72 | 70 | 83.3 |
| «Вентспилс» Вентспилс Латвия | 2 | 1 | 0 | 1 | 3 | 5 | -2 | 3 | 50.0 |
| «Виктория» Пльзень Чехия | 2 | 0 | 0 | 2 | 2 | 10 | -8 | 0 | 0.0 |
| «Вильянди» Вильянди Эстония | 8 | 8 | 0 | 0 | 30 | 2 | 28 | 24 | 100.0 |
| «Динабург» Даугавпилс Латвия | 2 | 0 | 1 | 1 | 1 | 2 | -1 | 1 | 16.7 |
| «Днепр» Днепр Украина | 2 | 0 | 0 | 2 | 1 | 5 | -4 | 0 | 0.0 |
| «Инфонет» Таллин Эстония | 20 | 8 | 7 | 5 | 34 | 23 | 11 | 31 | 51.7 |
| «Калев» Силламяэ Эстония | 33 | 21 | 7 | 5 | 67 | 30 | 37 | 70 | 70.7 |
| «Калев» Таллин Эстония | 32 | 24 | 6 | 2 | 94 | 21 | 73 | 78 | 81.3 |
| «Курессааре» Курессааре Эстония | 40 | 32 | 6 | 2 | 107 | 25 | 82 | 102 | 85.0 |
| «Легион» Таллин Эстония | 11 | 7 | 3 | 1 | 26 | 11 | 15 | 24 | 72.7 |
| «Лех» Познань Польша | 2 | 1 | 0 | 1 | 1 | 3 | -2 | 3 | 50.0 |
| «Лиепая» Лиепая Латвия | 1 | 1 | 0 | 0 | 4 | 1 | 3 | 3 | 100.0 |
| «Локомотив» Йыхви Эстония | 4 | 4 | 0 | 0 | 19 | 2 | 17 | 12 | 100.0 |
| «Лоотус» Кохтла-Ярве Эстония | 4 | 4 | 0 | 0 | 14 | 0 | 14 | 12 | 100.0 |
| «Маарду» Маарду Эстония | 4 | 4 | 0 | 0 | 19 | 1 | 18 | 12 | 100.0 |
| «Маккаби» Хайфа Израиль | 2 | 0 | 2 | 0 | 2 | 2 | 0 | 2 | 33.3 |
| «Мура» Мурска-Собота Словения | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 4 | -4 | 0 | 0.0 |
| «Нымме Юнайтед» Таллин Эстония | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 33.3 |
| «Османлыспор» Анкара Турция | 2 | 0 | 0 | 2 | 0 | 3 | -3 | 0 | 0.0 |
| «Пайде» Пайде Эстония | 57 | 31 | 14 | 12 | 105 | 60 | 45 | 107 | 62.6 |
| «Рига» Рига Латвия | 1 | 0 | 1 | 0 | 1 | 1 | 0 | 1 | 33.3 |
| «Ритеряй» Вильнюс Литва | 2 | 1 | 0 | 1 | 5 | 3 | 2 | 3 | 50.0 |
| «Селтик» Глазго Шотландия | 2 | 0 | 0 | 2 | 0 | 7 | -7 | 0 | 0.0 |
| «Спартак» Юрмала Латвия | 1 | 1 | 0 | 0 | 2 | 1 | 1 | 3 | 100.0 |
| «Стьярнан» Гардабайр Исландия | 2 | 1 | 0 | 1 | 1 | 3 | -2 | 3 | 50.0 |
| «Таммека» Тарту Эстония | 55 | 42 | 10 | 3 | 128 | 35 | 93 | 136 | 82.4 |
| «Тарвас» Раквере Эстония | 4 | 4 | 0 | 0 | 13 | 3 | 10 | 12 | 100.0 |
| «ТПС» Турку Финляндия | 1 | 1 | 0 | 0 | 2 | 1 | 1 | 3 | 100.0 |
| «Транс» Нарва Эстония | 57 | 34 | 13 | 10 | 117 | 43 | 74 | 115 | 67.3 |
| «Тулевик» Вильянди Эстония | 26 | 22 | 3 | 1 | 90 | 20 | 70 | 69 | 88.5 |
| «Ф91 Дюделанж» Дюделанж Люксембург | 2 | 0 | 0 | 2 | 1 | 4 | -3 | 0 | 0.0 |
| «Фехервар» Секешфехервар Венгрия | 2 | 0 | 1 | 1 | 1 | 4 | -3 | 1 | 16.7 |
| «ФКИ Левадия» Таллин Эстония | 61 | 15 | 21 | 25 | 58 | 83 | -25 | 66 | 36.1 |
| «Флора» Таллин Эстония | 58 | 15 | 17 | 26 | 64 | 75 | -11 | 62 | 35.6 |
| «Фрам» Рейкьявик Исландия | 2 | 1 | 1 | 0 | 3 | 2 | 1 | 4 | 66.7 |
| «Хазар» Ленкорань Азербайджан | 2 | 0 | 1 | 1 | 2 | 4 | -2 | 1 | 16.7 |
| «Харью» Лаагри Эстония | 4 | 2 | 1 | 1 | 4 | 3 | 1 | 7 | 58.3 |
| «ХИК» Хельсинки Финляндия | 3 | 1 | 2 | 0 | 3 | 2 | 1 | 5 | 55.6 |
| «Хонка» Эспоо Финляндия | 2 | 0 | 1 | 1 | 0 | 2 | -2 | 1 | 16.7 |
| «Шкендия» Тетово Северная Македония | 2 | 1 | 0 | 1 | 2 | 2 | 0 | 3 | 50.0 |