| «Айнтрахт» Франкфурт-на-Майне Германия | 2 | 0 | 0 | 2 | 2 | 4 | -2 | 0 | 0.0 |
| «Алга» Бишкек Кыргызстан | 1 | 0 | 1 | 0 | 1 | 1 | 0 | 1 | 33.3 |
| «Анортосис» Фамагуста Кипр | 2 | 0 | 2 | 0 | 4 | 4 | 0 | 2 | 33.3 |
| «АПОЭЛ» Никосия Кипр | 4 | 1 | 1 | 2 | 2 | 6 | -4 | 4 | 33.3 |
| «Аякс Ласнамяэ» Таллин Эстония | 4 | 4 | 0 | 0 | 33 | 1 | 32 | 12 | 100.0 |
| «Базель» Базель Швейцария | 2 | 0 | 0 | 2 | 0 | 5 | -5 | 0 | 0.0 |
| «Белшина» Бобруйск Беларусь | 1 | 1 | 0 | 0 | 3 | 1 | 2 | 3 | 100.0 |
| «Брондбю» Бреннбю Дания | 4 | 1 | 1 | 2 | 2 | 8 | -6 | 4 | 33.3 |
| «Брюгге» Брюгге Бельгия | 2 | 0 | 0 | 2 | 1 | 6 | -5 | 0 | 0.0 |
| «Бухара» Бухара Узбекистан | 1 | 0 | 0 | 1 | 1 | 2 | -1 | 0 | 0.0 |
| «Валмиера» Валмиера Латвия | 1 | 1 | 0 | 0 | 2 | 0 | 2 | 3 | 100.0 |
| «Вапрус» Пярну Эстония | 29 | 27 | 1 | 1 | 121 | 13 | 108 | 82 | 94.3 |
| «Вентспилс» Вентспилс Латвия | 2 | 0 | 0 | 2 | 0 | 5 | -5 | 0 | 0.0 |
| «Вильянди» Вильянди Эстония | 8 | 7 | 1 | 0 | 24 | 2 | 22 | 22 | 91.7 |
| «Винтертур» Винтертур Швейцария | 1 | 0 | 0 | 1 | 1 | 2 | -1 | 0 | 0.0 |
| «Волеренга» Осло Норвегия | 2 | 0 | 0 | 2 | 0 | 2 | -2 | 0 | 0.0 |
| «Гент» Гент Бельгия | 2 | 0 | 0 | 2 | 0 | 2 | -2 | 0 | 0.0 |
| «Горица» Нова-Горица Словения | 2 | 0 | 0 | 2 | 3 | 7 | -4 | 0 | 0.0 |
| «Динамо» Загреб Хорватия | 1 | 0 | 0 | 1 | 1 | 3 | -2 | 0 | 0.0 |
| «Динамо» Киев Украина | 2 | 0 | 0 | 2 | 0 | 6 | -6 | 0 | 0.0 |
| «Динамо» Минск Беларусь | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 2 | -2 | 0 | 0.0 |
| «Динамо» Тбилиси Грузия | 2 | 0 | 1 | 1 | 1 | 2 | -1 | 1 | 16.7 |
| «Домжале» Домжале Словения | 2 | 0 | 0 | 2 | 2 | 5 | -3 | 0 | 0.0 |
| «Инфонет» Таллин Эстония | 20 | 12 | 4 | 4 | 39 | 24 | 15 | 40 | 66.7 |
| «Калев» Силламяэ Эстония | 32 | 24 | 4 | 4 | 77 | 31 | 46 | 76 | 79.2 |
| «Калев» Таллин Эстония | 33 | 27 | 6 | 0 | 99 | 20 | 79 | 87 | 87.9 |
| «Каунас» Каунас Литва | 2 | 0 | 2 | 0 | 2 | 2 | 0 | 2 | 33.3 |
| «Копетдаг» Ашхабад Туркменистан | 1 | 0 | 0 | 1 | 1 | 4 | -3 | 0 | 0.0 |
| «Кукеси» Кукес Албания | 2 | 0 | 2 | 0 | 1 | 1 | 0 | 2 | 33.3 |
| «Курессааре» Курессааре Эстония | 39 | 35 | 2 | 2 | 126 | 16 | 110 | 107 | 91.5 |
| «Легион» Таллин Эстония | 11 | 11 | 0 | 0 | 32 | 6 | 26 | 33 | 100.0 |
| «Легия» Варшава Польша | 2 | 0 | 0 | 2 | 1 | 3 | -2 | 0 | 0.0 |
| «Лиллестрем» Лиллестрем Норвегия | 1 | 0 | 1 | 0 | 2 | 2 | 0 | 1 | 33.3 |
| «Линкольн Ред Импс» Гибралтар Гибралтар | 2 | 1 | 0 | 1 | 2 | 3 | -1 | 3 | 50.0 |
| «Локомотив» Йыхви Эстония | 4 | 4 | 0 | 0 | 17 | 6 | 11 | 12 | 100.0 |
| «Лоотус» Кохтла-Ярве Эстония | 4 | 4 | 0 | 0 | 19 | 1 | 18 | 12 | 100.0 |
| «Люн» Осло Норвегия | 2 | 0 | 2 | 0 | 1 | 1 | 0 | 2 | 33.3 |
| «Маарду» Маарду Эстония | 4 | 4 | 0 | 0 | 29 | 3 | 26 | 12 | 100.0 |
| «Мальме» Мальме Швеция | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 4 | -4 | 0 | 0.0 |
| «Ниса» Ашхабад Туркменистан | 2 | 2 | 0 | 0 | 3 | 0 | 3 | 6 | 100.0 |
| «Нымме Калью» Таллин Эстония | 58 | 26 | 17 | 15 | 75 | 64 | 11 | 95 | 54.6 |
| «Нымме Юнайтед» Таллин Эстония | 1 | 1 | 0 | 0 | 2 | 0 | 2 | 3 | 100.0 |
| «Омония» Никосия Кипр | 2 | 1 | 0 | 1 | 2 | 2 | 0 | 3 | 50.0 |
| «Пайде» Пайде Эстония | 60 | 46 | 11 | 3 | 154 | 41 | 113 | 149 | 82.8 |
| «Партизан» Белград Сербия | 4 | 1 | 0 | 3 | 2 | 12 | -10 | 3 | 25.0 |
| «Пахтакор» Ташкент Узбекистан | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 3 | -3 | 0 | 0.0 |
| «Пюник» Ереван Армения | 1 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 1 | 3 | 100.0 |
| «Работнички» Скопье Северная Македония | 2 | 1 | 0 | 1 | 1 | 2 | -1 | 3 | 50.0 |
| «Раднички» Ниш Сербия | 2 | 1 | 1 | 0 | 4 | 2 | 2 | 4 | 66.7 |
| «Ракув» Ченстохова Польша | 2 | 0 | 0 | 2 | 0 | 4 | -4 | 0 | 0.0 |
| «Рейкьявик» Рейкьявик Исландия | 1 | 1 | 0 | 0 | 2 | 1 | 1 | 3 | 100.0 |
| «Россия (U-18)» Россия | 1 | 0 | 0 | 1 | 1 | 2 | -1 | 0 | 0.0 |
| «Садам» Таллинн Эстония | 1 | 1 | 0 | 0 | 3 | 2 | 1 | 3 | 100.0 |
| «Сейняйоки» Сейняйоки Финляндия | 2 | 1 | 0 | 1 | 3 | 4 | -1 | 3 | 50.0 |
| «Судува» Мариямполе Литва | 3 | 1 | 1 | 1 | 5 | 5 | 0 | 4 | 44.4 |
| «Таммека» Тарту Эстония | 55 | 44 | 8 | 3 | 151 | 34 | 117 | 140 | 84.8 |
| «Тарвас» Раквере Эстония | 4 | 4 | 0 | 0 | 19 | 1 | 18 | 12 | 100.0 |
| «Транс» Нарва Эстония | 58 | 45 | 8 | 5 | 138 | 44 | 94 | 143 | 82.2 |
| «Тулевик» Вильянди Эстония | 26 | 21 | 4 | 1 | 74 | 17 | 57 | 67 | 85.9 |
| «ТФМК» Таллин Эстония | 2 | 1 | 1 | 0 | 4 | 2 | 2 | 4 | 66.7 |
| «Фарул» Констанца Румыния | 2 | 0 | 0 | 2 | 0 | 5 | -5 | 0 | 0.0 |
| «ФКИ Левадия» Таллин Эстония | 66 | 21 | 24 | 21 | 93 | 85 | 8 | 87 | 43.9 |
| «ФКСБ» Бухарест Румыния | 2 | 1 | 0 | 1 | 4 | 5 | -1 | 3 | 50.0 |
| «Флориана» Флориана Мальта | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 33.3 |
| «Хапоэль» Беэр-Шева Израиль | 2 | 0 | 0 | 2 | 2 | 7 | -5 | 0 | 0.0 |
| «Харью» Лаагри Эстония | 4 | 4 | 0 | 0 | 10 | 2 | 8 | 12 | 100.0 |
| «Хибернианс» Паола Мальта | 2 | 2 | 0 | 0 | 5 | 0 | 5 | 6 | 100.0 |
| «ХИК» Хельсинки Финляндия | 2 | 1 | 1 | 0 | 2 | 1 | 1 | 4 | 66.7 |
| «Цюрих» Цюрих Швейцария | 1 | 0 | 0 | 1 | 1 | 4 | -3 | 0 | 0.0 |
| «Шагадам» Туркменбашы Туркменистан | 1 | 1 | 0 | 0 | 3 | 0 | 3 | 3 | 100.0 |
| «Шахтер» Донецк Украина | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 1 | -1 | 0 | 0.0 |
| «Шемрок Роверс» Дублин Ирландия | 4 | 2 | 1 | 1 | 5 | 3 | 2 | 7 | 58.3 |
| «Шериф» Тирасполь Молдова | 3 | 0 | 1 | 2 | 1 | 6 | -5 | 1 | 11.1 |
| «Ширак» Гюмри Армения | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 1 | -1 | 0 | 0.0 |
| «Эсбьерг» Эсбьерг Дания | 2 | 1 | 0 | 1 | 2 | 7 | -5 | 3 | 50.0 |
| «Юргорден» Стокгольм Швеция | 2 | 0 | 2 | 0 | 2 | 2 | 0 | 2 | 33.3 |
| «Янг Бойз» Берн Швейцария | 1 | 0 | 0 | 1 | 1 | 4 | -3 | 0 | 0.0 |