| «Авангард» Курск Россия | 5 | 3 | 1 | 1 | 10 | 5 | 5 | 10 | 66.7 |
| «Автодор» Владикавказ Россия | 29 | 10 | 7 | 12 | 32 | 41 | -9 | 37 | 42.5 |
| «Академия» Тольятти Россия | 4 | 0 | 2 | 2 | 3 | 8 | -5 | 2 | 16.7 |
| «Академия им. В.Понедельника» Ростов-на-Дону Россия | 4 | 3 | 1 | 0 | 8 | 3 | 5 | 10 | 83.3 |
| «Алания» Владикавказ Россия | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 3 | -3 | 0 | 0.0 |
| «Алания-2» Владикавказ Россия | 5 | 3 | 1 | 1 | 8 | 5 | 3 | 10 | 66.7 |
| «Алания-Д» Владикавказ Россия | 7 | 3 | 1 | 3 | 9 | 11 | -2 | 10 | 47.6 |
| «Анапа» Анапа Россия | 25 | 8 | 7 | 10 | 30 | 34 | -4 | 31 | 41.3 |
| «Ангушт» Назрань Россия | 32 | 11 | 6 | 15 | 34 | 45 | -11 | 39 | 40.6 |
| «Анжи» Махачкала Россия | 9 | 2 | 3 | 4 | 14 | 25 | -11 | 9 | 33.3 |
| «Анжи-2» Махачкала Россия | 2 | 1 | 1 | 0 | 2 | 1 | 1 | 4 | 66.7 |
| «АПК» Морозовск Россия | 10 | 5 | 3 | 2 | 13 | 9 | 4 | 18 | 60.0 |
| «Арарат-2» Ереван Армения | 2 | 1 | 0 | 1 | 7 | 2 | 5 | 3 | 50.0 |
| «Арзамас» Арзамас Россия | 4 | 2 | 0 | 2 | 5 | 8 | -3 | 6 | 50.0 |
| «Армавир» Армавир Россия | 16 | 1 | 3 | 12 | 8 | 26 | -18 | 6 | 12.5 |
| «Армавир» Армавир Армения | 4 | 1 | 2 | 1 | 7 | 8 | -1 | 5 | 41.7 |
| «Арсенал» Тула Россия | 2 | 1 | 0 | 1 | 1 | 1 | 0 | 3 | 50.0 |
| «Асмарал» Москва Россия | 6 | 2 | 0 | 4 | 6 | 11 | -5 | 6 | 33.3 |
| «Астрахань» Астрахань Россия | 31 | 18 | 5 | 8 | 45 | 31 | 14 | 59 | 63.4 |
| «Атом» Нововоронеж Россия | 2 | 2 | 0 | 0 | 4 | 0 | 4 | 6 | 100.0 |
| «Атоммаш» Волгодонск Россия | 8 | 4 | 0 | 4 | 14 | 12 | 2 | 12 | 50.0 |
| «Афипс» Афипский Россия | 10 | 2 | 1 | 7 | 7 | 14 | -7 | 7 | 23.3 |
| «Ахмат» Грозный Россия | 22 | 6 | 6 | 10 | 24 | 39 | -15 | 24 | 36.4 |
| «Ахмат-2» Грозный Россия | 4 | 1 | 2 | 1 | 4 | 4 | 0 | 5 | 41.7 |
| «Балтика» Калининград Россия | 6 | 2 | 0 | 4 | 5 | 15 | -10 | 6 | 33.3 |
| «Батайск-2007» Батайск Россия | 8 | 3 | 1 | 4 | 10 | 14 | -4 | 10 | 41.7 |
| «Бештау» Лермонтов Россия | 2 | 2 | 0 | 0 | 7 | 2 | 5 | 6 | 100.0 |
| «Биолог-Новокубанск» Прогресс Россия | 29 | 12 | 7 | 10 | 30 | 35 | -5 | 43 | 49.4 |
| «Венец» Гулькевичи Россия | 10 | 9 | 0 | 1 | 27 | 8 | 19 | 27 | 90.0 |
| «Витязь» Крымск Россия | 18 | 9 | 2 | 7 | 29 | 16 | 13 | 29 | 53.7 |
| «Волга» Тверь Россия | 5 | 2 | 0 | 3 | 7 | 5 | 2 | 6 | 40.0 |
| «Волга» Ульяновск Россия | 6 | 4 | 1 | 1 | 9 | 2 | 7 | 13 | 72.2 |
| «Волгарь» Астрахань Россия | 23 | 7 | 4 | 12 | 23 | 32 | -9 | 25 | 36.2 |
| «Волгарь-Астрахань» Астрахань Россия | 2 | 1 | 1 | 0 | 4 | 2 | 2 | 4 | 66.7 |
| «Гёязань» Казах Азербайджан | 2 | 0 | 1 | 1 | 1 | 3 | -2 | 1 | 16.7 |
| «Дагдизель» Каспийск Россия | 15 | 5 | 1 | 9 | 11 | 22 | -11 | 16 | 35.6 |
| «Динамо» Брянск Россия | 4 | 2 | 1 | 1 | 3 | 2 | 1 | 7 | 58.3 |
| «Динамо» Вологда Россия | 4 | 1 | 3 | 0 | 6 | 5 | 1 | 6 | 50.0 |
| «Динамо» Махачкала Россия | 6 | 2 | 1 | 3 | 4 | 12 | -8 | 7 | 38.9 |
| «Динамо» Минск Беларусь | 2 | 0 | 1 | 1 | 1 | 4 | -3 | 1 | 16.7 |
| «Динамо» Ставрополь Россия | 35 | 10 | 4 | 21 | 37 | 66 | -29 | 34 | 32.4 |
| «Динамо» Ставрополь Россия | 48 | 21 | 11 | 16 | 61 | 53 | 8 | 74 | 51.4 |
| «Динамо» Сухуми СССР | 3 | 2 | 0 | 1 | 7 | 4 | 3 | 6 | 66.7 |
| «Динамо-Дагестан-Судостроитель» Махачкала Россия | 18 | 6 | 5 | 7 | 27 | 23 | 4 | 23 | 42.6 |
| «Динамо-СПб» Санкт-Петербург Россия | 2 | 2 | 0 | 0 | 6 | 4 | 2 | 6 | 100.0 |
| «Енисей» Красноярск Россия | 2 | 1 | 0 | 1 | 3 | 2 | 1 | 3 | 50.0 |
| «Ессентуки» Ессентуки Россия | 6 | 4 | 1 | 1 | 8 | 5 | 3 | 13 | 72.2 |
| «Жемчужина» Будённовск Россия | 6 | 5 | 0 | 1 | 13 | 4 | 9 | 15 | 83.3 |
| «Жемчужина» Сочи Россия | 11 | 4 | 1 | 6 | 15 | 15 | 0 | 13 | 39.4 |
| «Жемчужина-2» Сочи Россия | 2 | 1 | 1 | 0 | 5 | 1 | 4 | 4 | 66.7 |
| «Жемчужина-Сочи» Сочи Россия | 4 | 0 | 1 | 3 | 3 | 8 | -5 | 1 | 8.3 |
| «Заря» Калуга Россия | 2 | 1 | 1 | 0 | 2 | 0 | 2 | 4 | 66.7 |
| «Заря-СУЭК» Ленинск-Кузнецкий Россия | 8 | 2 | 4 | 2 | 10 | 8 | 2 | 10 | 41.7 |
| «Звезда» Иркутск Россия | 6 | 2 | 1 | 3 | 9 | 8 | 1 | 7 | 38.9 |
| «Звезда» Пермь Россия | 6 | 2 | 1 | 3 | 7 | 11 | -4 | 7 | 38.9 |
| «Зенит» Санкт-Петербург Россия | 6 | 3 | 2 | 1 | 8 | 5 | 3 | 11 | 61.1 |
| «Знамя Труда» Орехово-Зуево Россия | 2 | 2 | 0 | 0 | 6 | 2 | 4 | 6 | 100.0 |
| «Ижевск» Ижевск Россия | 4 | 1 | 1 | 2 | 7 | 9 | -2 | 4 | 33.3 |
| «Интер» Черкесск Россия | 4 | 2 | 2 | 0 | 6 | 4 | 2 | 8 | 66.7 |
| «Иристон» Владикавказ Россия | 4 | 3 | 0 | 1 | 13 | 1 | 12 | 9 | 75.0 |
| «Иртыш» Омск Россия | 8 | 4 | 0 | 4 | 13 | 11 | 2 | 12 | 50.0 |
| «Искра» Ереван СССР | 2 | 2 | 0 | 0 | 7 | 1 | 6 | 6 | 100.0 |
| «Искра» Новоалександровск Россия | 1 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 1 | 3 | 100.0 |
| «Кавказкабель» Прохладный Россия | 10 | 5 | 1 | 4 | 17 | 12 | 5 | 16 | 53.3 |
| «КАМАЗ» Набережные Челны Россия | 4 | 2 | 0 | 2 | 8 | 8 | 0 | 6 | 50.0 |
| «Колос» Краснодар Россия | 5 | 4 | 1 | 0 | 9 | 3 | 6 | 13 | 86.7 |
| «Колхети-1913» Поти Грузия | 2 | 1 | 0 | 1 | 2 | 1 | 1 | 3 | 50.0 |
| «Краснодар» Краснодар Россия | 3 | 0 | 0 | 3 | 2 | 10 | -8 | 0 | 0.0 |
| «Краснодар-2» Краснодар Россия | 10 | 4 | 2 | 4 | 14 | 21 | -7 | 14 | 46.7 |
| «Краснодар-2000» Краснодар Россия | 24 | 8 | 3 | 13 | 28 | 41 | -13 | 27 | 37.5 |
| «Краснодар-3» Краснодар Россия | 5 | 1 | 0 | 4 | 5 | 12 | -7 | 3 | 20.0 |
| «Краснознаменск» Краснознаменск Россия | 2 | 1 | 1 | 0 | 3 | 2 | 1 | 4 | 66.7 |
| «Кристалл» Смоленск Россия | 4 | 1 | 1 | 2 | 5 | 5 | 0 | 4 | 33.3 |
| «Крылья Советов» Самара Россия | 4 | 0 | 2 | 2 | 2 | 5 | -3 | 2 | 16.7 |
| «Кубань» Краснодар Россия | 6 | 2 | 0 | 4 | 7 | 11 | -4 | 6 | 33.3 |
| «Кубань» Краснодар Россия | 17 | 9 | 3 | 5 | 29 | 17 | 12 | 30 | 58.8 |
| «Кубань Холдинг» Павловская Россия | 7 | 1 | 3 | 3 | 6 | 10 | -4 | 6 | 28.6 |
| «Кубань-2» Краснодар Россия | 5 | 2 | 2 | 1 | 5 | 5 | 0 | 8 | 53.3 |
| «Кяпаз» Гянджа Азербайджан | 2 | 1 | 0 | 1 | 6 | 4 | 2 | 3 | 50.0 |
| «Лада-Тольятти» Тольятти Россия | 8 | 3 | 0 | 5 | 9 | 14 | -5 | 9 | 37.5 |
| «Легион» Махачкала Россия | 14 | 6 | 2 | 6 | 13 | 17 | -4 | 20 | 47.6 |
| «Леон Сатурн» Раменское Россия | 6 | 2 | 2 | 2 | 8 | 10 | -2 | 8 | 44.4 |
| «Локомотив» Минеральные Воды Россия | 6 | 5 | 0 | 1 | 19 | 8 | 11 | 15 | 83.3 |
| «Локомотив» Нижний Новгород Россия | 2 | 0 | 0 | 2 | 1 | 4 | -3 | 0 | 0.0 |
| «Локомотив» Санкт-Петербург Россия | 6 | 1 | 1 | 4 | 3 | 7 | -4 | 4 | 22.2 |
| «Лори» Ванадзор Армения | 6 | 4 | 0 | 2 | 12 | 8 | 4 | 12 | 66.7 |
| «Луч» Владивосток Россия | 8 | 1 | 6 | 1 | 6 | 6 | 0 | 9 | 37.5 |
| «Машук-КМВ» Пятигорск Россия | 49 | 17 | 9 | 23 | 45 | 59 | -14 | 60 | 40.8 |
| «Мерцхали» Озургети Грузия | 2 | 1 | 0 | 1 | 4 | 2 | 2 | 3 | 50.0 |
| «Металлург» Липецк Россия | 14 | 5 | 4 | 5 | 20 | 23 | -3 | 19 | 45.2 |
| «МИТОС» Новочеркасск Россия | 12 | 2 | 3 | 7 | 14 | 22 | -8 | 9 | 25.0 |
| «Моздок» Моздок Россия | 8 | 6 | 2 | 0 | 21 | 5 | 16 | 20 | 83.3 |
| «Нарт» Нарткала Россия | 8 | 5 | 1 | 2 | 16 | 9 | 7 | 16 | 66.7 |
| «Нарт» Черкесск Россия | 22 | 12 | 3 | 7 | 34 | 23 | 11 | 39 | 59.1 |
| «Немком» Краснодар Россия | 2 | 2 | 0 | 0 | 5 | 2 | 3 | 6 | 100.0 |
| «Нефтехимик» Нижнекамск Россия | 10 | 3 | 2 | 5 | 8 | 9 | -1 | 11 | 36.7 |
| «Нефтяник» Уфа Россия | 4 | 2 | 0 | 2 | 5 | 6 | -1 | 6 | 50.0 |
| «Ника» Красный Сулин Россия | 2 | 1 | 0 | 1 | 4 | 4 | 0 | 3 | 50.0 |
| «Океан» Находка Россия | 6 | 3 | 1 | 2 | 6 | 10 | -4 | 10 | 55.6 |
| «Олимп» Кисловодск Россия | 5 | 4 | 1 | 0 | 14 | 4 | 10 | 13 | 86.7 |
| «Олимпия» Волгоград Россия | 16 | 1 | 6 | 9 | 14 | 31 | -17 | 9 | 18.8 |
| «Олимпия» Геленджик Россия | 2 | 0 | 0 | 2 | 1 | 3 | -2 | 0 | 0.0 |
| «Орёл» Орёл Россия | 2 | 1 | 0 | 1 | 3 | 1 | 2 | 3 | 50.0 |
| «Пионер» Ленинградская Россия | 1 | 0 | 1 | 0 | 3 | 3 | 0 | 1 | 33.3 |
| «Прометей» Ереван СССР | 2 | 2 | 0 | 0 | 4 | 1 | 3 | 6 | 100.0 |
| «Ростов» Ростов-на-Дону Россия | 9 | 3 | 1 | 5 | 19 | 21 | -2 | 10 | 37.0 |
| «Ростов-2» Ростов-на-Дону Россия | 4 | 3 | 1 | 0 | 10 | 0 | 10 | 10 | 83.3 |
| «Ротор» Волгоград Россия | 4 | 1 | 2 | 1 | 4 | 4 | 0 | 5 | 41.7 |
| «Ротор» Волгоград Россия | 11 | 4 | 2 | 5 | 20 | 18 | 2 | 14 | 42.4 |
| «Ротор» Волгоград Россия | 4 | 0 | 2 | 2 | 1 | 4 | -3 | 2 | 16.7 |
| «Ротор-2» Волгоград Россия | 4 | 1 | 2 | 1 | 3 | 3 | 0 | 5 | 41.7 |
| «Рубин» Казань Россия | 2 | 0 | 0 | 2 | 1 | 5 | -4 | 0 | 0.0 |
| «Салют Белгород» Белгород Россия | 10 | 7 | 1 | 2 | 20 | 8 | 12 | 22 | 73.3 |
| «Самтредиа» Самтредиа Грузия | 2 | 1 | 0 | 1 | 4 | 2 | 2 | 3 | 50.0 |
| «Сатурн-1991» Санкт-Петербург Россия | 6 | 2 | 1 | 3 | 4 | 7 | -3 | 7 | 38.9 |
| «Сибирь» Новосибирск Россия | 5 | 1 | 0 | 4 | 5 | 7 | -2 | 3 | 20.0 |
| «СКА» Ростов-на-Дону Россия | 25 | 10 | 7 | 8 | 40 | 40 | 0 | 37 | 49.3 |
| «СКА» Ростов-на-Дону Россия | 19 | 6 | 2 | 11 | 17 | 31 | -14 | 20 | 35.1 |
| «Славянск» Славянск-на-Кубани Россия | 13 | 7 | 5 | 1 | 22 | 11 | 11 | 26 | 66.7 |
| «Славянский» Славянск-на-Кубани Россия | 4 | 1 | 3 | 0 | 6 | 4 | 2 | 6 | 50.0 |
| «Сокол» Саратов Россия | 24 | 9 | 4 | 11 | 30 | 43 | -13 | 31 | 43.1 |
| «Сочи» Сочи Россия | 4 | 0 | 1 | 3 | 2 | 6 | -4 | 1 | 8.3 |
| «Сочи-04» Сочи Россия | 11 | 4 | 4 | 3 | 12 | 12 | 0 | 16 | 48.5 |
| «СОЮЗ-Газпром» Ижевск Россия | 6 | 1 | 1 | 4 | 6 | 11 | -5 | 4 | 22.2 |
| «Спартак» Нальчик Россия | 38 | 15 | 10 | 13 | 42 | 44 | -2 | 55 | 48.2 |
| «Спартак» Рязань Россия | 4 | 2 | 1 | 1 | 7 | 1 | 6 | 7 | 58.3 |
| «Спартак» Тамбов Россия | 2 | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 | 1 | 4 | 66.7 |
| «Спартак-Владикавказ» Владикавказ Россия | 13 | 6 | 2 | 5 | 20 | 14 | 6 | 20 | 51.3 |
| «Спитак» Спитак Армения | 2 | 1 | 0 | 1 | 3 | 5 | -2 | 3 | 50.0 |
| «Ставрополь» Ставрополь Россия | 2 | 0 | 0 | 2 | 2 | 9 | -7 | 0 | 0.0 |
| «Стрела» Воронеж Россия | 2 | 2 | 0 | 0 | 7 | 1 | 6 | 6 | 100.0 |
| «СШ Черноморец» Новороссийск Россия | 2 | 2 | 0 | 0 | 5 | 1 | 4 | 6 | 100.0 |
| «Таганрог» Таганрог Россия | 19 | 8 | 3 | 8 | 25 | 21 | 4 | 27 | 47.4 |
| «Текстильщик» Иваново Россия | 4 | 2 | 0 | 2 | 7 | 7 | 0 | 6 | 50.0 |
| «Текстильщик» Камышин Россия | 14 | 8 | 4 | 2 | 30 | 14 | 16 | 28 | 66.7 |
| «Томь» Томск Россия | 2 | 1 | 0 | 1 | 1 | 1 | 0 | 3 | 50.0 |
| «Торпедо» Владимир Россия | 10 | 4 | 1 | 5 | 18 | 15 | 3 | 13 | 43.3 |
| «Торпедо» Георгиевск Россия | 2 | 2 | 0 | 0 | 8 | 0 | 8 | 6 | 100.0 |
| «Торпедо» Москва Россия | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 1 | -1 | 0 | 0.0 |
| «Торпедо» Таганрог Россия | 21 | 13 | 4 | 4 | 38 | 22 | 16 | 43 | 68.3 |
| «Туапсе» Туапсе Россия | 4 | 3 | 0 | 1 | 6 | 6 | 0 | 9 | 75.0 |
| «Тюмень» Тюмень Россия | 2 | 0 | 1 | 1 | 2 | 5 | -3 | 1 | 16.7 |
| «Урал» Екатеринбург Россия | 4 | 3 | 0 | 1 | 5 | 2 | 3 | 9 | 75.0 |
| «Уралан» Элиста Россия | 26 | 11 | 3 | 12 | 27 | 29 | -2 | 36 | 46.2 |
| «Факел» Воронеж Россия | 9 | 2 | 1 | 6 | 7 | 15 | -8 | 7 | 25.9 |
| «ФАЮР» Беслан Россия | 4 | 2 | 0 | 2 | 6 | 2 | 4 | 6 | 50.0 |
| «Форте» Таганрог Россия | 7 | 1 | 0 | 6 | 7 | 16 | -9 | 3 | 14.3 |
| «Химик» Белореченск Россия | 3 | 2 | 0 | 1 | 5 | 4 | 1 | 6 | 66.7 |
| «Химик» Семилуки СССР | 2 | 1 | 1 | 0 | 4 | 3 | 1 | 4 | 66.7 |
| «Чайка» Песчанокопское Россия | 10 | 2 | 1 | 7 | 6 | 15 | -9 | 7 | 23.3 |
| «Черноморец» Новороссийск Россия | 56 | 15 | 6 | 35 | 51 | 111 | -60 | 51 | 30.4 |
| «Чита» Чита Россия | 10 | 6 | 0 | 4 | 15 | 15 | 0 | 18 | 60.0 |
| «Шахтёр» Шахты Россия | 12 | 8 | 1 | 3 | 24 | 9 | 15 | 25 | 69.4 |
| «Шинник» Ярославль Россия | 6 | 2 | 2 | 2 | 7 | 9 | -2 | 8 | 44.4 |
| «Ширак» Гюмри Армения | 4 | 3 | 0 | 1 | 5 | 2 | 3 | 9 | 75.0 |
| «Энергия» Волжский Россия | 36 | 14 | 9 | 13 | 50 | 52 | -2 | 51 | 47.2 |
| «Эрзу» Грозный Россия | 4 | 2 | 0 | 2 | 4 | 5 | -1 | 6 | 50.0 |